（一）顯微鏡有以下的機械部分
　　1.上部圓形中空的長筒為顯微鏡鏡筒，目鏡安裝于筒口上端，筒口下端與連接物鏡轉換盤。這樣設計的作用可以保護成像的亮度與光路。
　　2.轉換盤固在目鏡筒下方，分兩層，上層固著不動，下層可自由轉動。轉換盤具有1~6個圓孔不等，方便安裝不同倍數的顯微鏡物鏡。
　　3.細準焦螺旋位于鏡臂的下方，細準焦螺旋移動范圍比粗準焦螺旋要小，可以細調焦距。
　　4.粗準焦螺旋設計在鏡臂的上方，可以轉動，可讓鏡筒方便上下移動，從而調節焦距。
　　5.在鏡臂的下方是鏡座，顯微鏡的底部，呈扇形的金屬座。可穩固的支撐鏡身。
　　6.鏡柱從鏡座向上直立的短柱。上連鏡臂，下連鏡座，可支撐載物臺以及鏡臂。
　　7.傾斜關節鏡柱和鏡臂交界處有一個能活動的關節。讓顯微鏡在一定的范圍內后傾（傾斜45°）便于觀察。在使用臨時的封片顯微觀察時，不能使用傾斜關節，特別是顯微鏡觀察含酸性試劑時嚴禁使用，避免污損鏡體。
　　8.載物臺從鏡臂向前方伸出的金屬平臺。呈方形或圓形，是放置玻片標本的區域。它的中央有通光孔，通光孔的兩邊設計有彈性的金屬壓片夾，用來壓住載玻片。研究級別的顯微鏡，載物臺一般設計有推進器，、除夾住切片外，可以讓切片試樣在載物臺上移動。
　　（二）顯微鏡的光學部分
　　1.目鏡它是安裝在鏡筒中的直接用于雙眼觀察的鏡頭。是由一組透鏡組成的，目鏡可以讓物鏡成倍地分辨、放大物像，例如5×、10×、15×、20X
　　2.物鏡是決定顯微成像效果的關鍵部件。物鏡安裝在轉換盤上，也是由一組透鏡組成的，物鏡可以把試樣清晰地放大。放大可以選用不同倍率的物鏡，即：低倍物鏡（8×或10×）、高倍物鏡（40×或45×）和油浸物鏡（90×或100×），根據試樣大小，實際情況來選擇物鏡。顯微鏡的放大倍數是目鏡倍數乘以物鏡的倍數。
　　3.聚光器由由凹透鏡組合成的，光線由聚光器集中反光鏡在投射的。在鏡柱前設計有聚光器調節螺旋，可以讓聚光器升降，可以調節光線的亮度，下降后亮度會隨之降低，上升時亮度會加強。
　　4.反光鏡在聚光器的下面部分，是一個一面平而另一面凹的雙面圓鏡。雙面圓鏡可以任意面翻轉，光線較強時采用平面鏡，反之使用凹面鏡。
　　5.可變光闌也叫虹彩光圈，它采用多片金屬片組成，一般應用在比較高端的顯微鏡儀器上。使用中通過移動其手柄來操控聚光器透鏡的通光范圍，用來調節光的明亮度。虹彩光圈下會有金屬圈，上面裝備有濾光片，可以調節光源的色調。